여성신학연구소는 현대 사회와 교회의 다양하고 복잡한 과제들을 수행할 수 있는 “전문적” 여성 신학자 및 여성 목회자를 양성하고, 한국여성신학운동에 실천적, 학문적 기반을 제공하여 새로운 한국적 여성신학을 정립하고자 1993년 3월 4일 초교파적 연구기관으로 설립되었다. 본 연구소의 연구 목적은 학문 연구와 교육 훈련을 통하여 한국 교회 여성들에게 여성문제에 대한 의식을 불러일으켜 여성해방을 향한 한국 교회 및 세계 교회의 신학 발전과 제도 개혁을 촉진시키는 데 있다. 이러한 목적을 달성하기 위하여 본 연구소에서는 한국 여성의 경험을 신학적으로 성찰하고, 교회의 전통을 여성학적 관점에서 성찰하며, 새로운 여성신학을 정립하는 학문 연구와 함께 교회 여성들을 위한 신학 교육을 실시하고 있다. 주요 사업으로 연구와 출판, 교육과 훈련, 자료센터 운영, 국제 학술모임 등이 있다. 연구 논문지 「여성신학 논집」과 「Ewha Journal of Feminist Theology」를 발간하고 있다.